(1)部门协作不顺畅。国土空间规划编制涉及发改、自然资源、住建、交通等多个部门,存在多头管理、职能交叉的问题,由于各部门空间规划工作在规划期限、范围和方法等方面存在差异,导致规划工作总体推进较为缓慢。(2)统计标准不一致。各部门缺乏统一的衡量技术指标体系,导致数据衔接性、连续性和发布时效性差。同时,在空间划分方面也存在差异,如主体功能区划分为重点开发区、优化开发区、限制开发区和禁止开发区,城乡规划划分为已建区、适建区、限建区。(3)保障机制不健全。在国土空间规划编制过程中,未建立有效的目标共识机制、信息共享机制和管理协同机制。同时,“多规合一”规划编制、落实的法律保障机制和规划监督体系不健全,缺乏完善的全流程跟踪监督问责和评价机制,影响了“多规合一”的实施效果。